Zlecenie 7628483 - ZO/01/2020 - usługi badawcze W związku z planowanym...

a w ramach Poddziałania 1.1.1 POIR, Billennium Healthcare Sp. z o.o. wszczyna postępowanie ofertowe nr ZO/01/2020 zgodne z zasadą konkurencyjności zmierzające do wyboru najkorzystniejszej oferty.
Przedmiotem zamówienia jest wykonanie prac badawczych mających na celu opracowanie metod przetwarzania i wizualizacji obrazów rezonansu magnetycznego MR mózgowia. Przedmiotem badań będą w szczególności algorytmy wstępnego przetwarzania obrazów, tj. normalizacja, odszumianie oraz segmentacja obrazów wolumetrycznych w oparciu o metody głębokiego uczenia. Szczegóły planowanych do przeprowadzenia badań mogą ulec zmianie na podstawie uzyskanych wyników cząstkowych w poszczególnych zadaniach. Cel zamówienia Działając zgodnie z zasadą konkurencyjności, firma Billennium Healthcare Sp. z o.o. ogłasza postępowanie w trybie zapytania ofertowego celem wyłonienia Wykonawcy prac badawczo-rozwojowych obejmujących opracowanie metod wstępnego przetwarzania obrazów wolumetrycznych rezonansu magnetycznego MR mózgowia. Z uwagi na olbrzymią różnorodność protokołów diagnostycznych obrazowania MR nowotworów mózgu prowadzonych przez instytucje medyczne wymagane jest opracowanie zrównoleglonych algorytmów, które w sposób automatyczny dokonają normalizacji, odszumiania, segmentacji oraz wizualizacji struktur anatomicznych mózgowia z wykorzystaniem metod uczenia maszynowego.
Usługi te zostaną wykonane na potrzeby realizacji projektu B+R pt. System wspierający neurodiagnostykę guza mózgu w oparciu o obrazowanie wielomodalne MRI wykorzystujący zaawansowane algorytmy przetwarzania obrazów i głębokiego uczenia maszynowego, który będzie ubiegał się o dofinansowanie w ramach Programu Operacyjnego Innowacyjny Rozwój, Poddziałanie 1.1.1: Badania przemysłowe i prace rozwojowe realizowane przez przedsiębiorstwa. Przedmiot zamówienia Przedmiotem zamówienia jest wykonanie prac badawczych pozwalających na opracowaniu metod i algorytmów przetwarzania równoległego sygnałów MR 3D mózgowia w sekwencjach T1, T2, FLAIR oraz MR dyfuzyjne i perfuzyjne. Zamówienie będzie składać się z 3 zadań, dla których planowany zakres prac badawczo-rozwojowych obejmuje:
1. Opracowanie metod i algorytmów odszumiania oraz normalizacji intensywności wejściowych obrazów MR mózgowia do skali referencyjnej i znormalizowanej dla każdej sekwencji oraz obrazów MR 3D (w sekwencjach T1, T2, FLAIR, dyfuzyjne DTI/DWI, perfuzyjne) za pomocą sieci neuronowych. Wynikiem tego zadania jest zbudowanie, wytrenowanie i walidacja modelu konwolucyjnej sieci neuronowej. Dopuszczalne technologie: C++, python, Tensorflow.
2. Zbadanie możliwości architektury konwolucyjnej sieci neuronowej do realizacji automatycznej segmentacji tkanek mózgowia w obrazach MR 3D (w sekwencjach T1, T2, FLAIR, MR dyfuzyjne DTI/DWI, perfuzyjne), opartej na uczeniu nienadzorowanym bez danych etykietowanych. Wynikiem tego zadania jest zbudowanie, wytrenowanie i walidacja modelu konwolucyjnej sieci neuronowej działającej w sposób nienadzorowany. Dopuszczalne technologie: C++, python, Tensorflow.
3. Opracowanie metod wizualizacji trójwymiarowej struktur mózgowia na bazie obrazów MR (rendering wolumetryczny i izo-powierzchni). Wynikiem tego zadania jest kod źródłowy dla mechanizmów wizualizacji opartej na bibliotece OpenGL. Dopuszczalne technologie: C++, python, OpenGL.