Przetarg 12463098 - Wygenerowanie 10 polimorficznych loci mikrosatelitarnych dla...

anie 10 polimorficznych loci mikrosatelitarnych oraz opracowanie starterów do tych loci dla 2 gatunków grzybów wielkoowocnikowych:
ZADANIE 1
Opracowanie ww. loci mikrosatelitarnych okratka australijskiego - Clathrus archeri (Berk.) Dring - na podstawie materiału biologicznego dostarczonego przez Zamawiającego. Próby do analiz będą stanowiły izolaty DNA otrzymane z 20 owocników okratka australijskiego reprezentujących populacje różnego pochodzenia.
wygenerowanie bibliotek genomowych z wykorzystaniem platformy Illumina MiSeq (lub nowszej generacji). Na podstawie tych danych zaprojektowanie 500 par primerów w regionach flankujących regiony mikrosatelitarne.
wykonanie multiplexu dla 40 par starterów dla 2-5 par, testowanie primerów na 20 owocnikach dostarczonych przez zamawiającego
wybór minimalnie 10 par starterów najlepiej amplifikujące polimorficzne loci zidentyfikowane dla analizowanego gatunku.
Materiał do analiz stanowić będą izolaty DNA dostarczone jednorazowo, w terminie co najmniej 60 dni przed terminem realizacji zamówienia.
Termin realizacji zamówienia: 24.06.2026 r.
ZADANIE 2
Opracowanie ww. loci mikrosatelitarnych pierścieniaka uprawnego (Stropharia rugosoannulata Farl. ex Murrill) na podstawie materiału biologicznego dostarczonego przez Zamawiającego. Próby do analiz będą stanowiły izolaty DNA otrzymane z 20 owocników pierścieniaka uprawnego reprezentujących populacje różnego pochodzenia.
wygenerowanie bibliotek genomowych z wykorzystaniem platformy Illumina MiSeq (lub nowszej generacji). Na podstawie tych danych zaprojektowanie 500 par primerów w regionach flankujących regiony mikrosatelitarne.
wykonanie multiplexu dla 40 par starterów dla 2-5 par, testowanie primerów na 20 owocnikach dostarczonych przez zamawiającego
wybór minimalnie 10 par starterów najlepiej amplifikujące polimorficzne loci zidentyfikowane dla analizowanego gatunku.
Materiał do analiz stanowić będą izolaty DNA dostarczone jednorazowo, w terminie co najmniej 40 dni przed terminem realizacji zamówienia.