Przetarg 1683049 - Monitoring genetyczny, Monitoring parazytologiczny oraz...

żubra w Polsce - część południowa. Zadanie nr 1 Przedmiotem zamówienia jest: Monitoring genetyczny I. Monitoring genetyczny ma na celu ocenę populacji żubrów pod względem genetycznym, oraz określeniem genotypów, o które należy wzbogacić pule genową stada bieszczadzkiego. II. Wykonawcy zostaną dostarczone próbki do badań genetycznych, zebrane w ramach zadania Kolekcja tkanek żubrów ze stada w Bieszczadach. Sposób dostarczania prób do analizy ma zostać ustalony z Wykonawcą ww zadania. 1. Próbki dostarczone Wykonawcy do oceny będą stanowiły materiał biologiczny w postaci: włosów zebranych z legowisk zimowych, lub odpowiednio zakonserwowanych krwi lub innych tkanek pobranych od padłych, eliminowanych lub usypianych żubrów. 2. Ilość materiału dostarczonego do analizy to maksymalnie 75 próbek w całym okresie obowiązywania umowy. Ilość próbek dostarczonych do badań będzie zależna od dostępności materiału genetycznego. III. Metodyka monitoringu genetycznego: 1. Analiza molekularna a) Izolacja DNA: Izolacja metodą kolumnową z określeniem efektywności przy pomocy pomiaru spektrofotometrycznego b) Amplifikacja DNA: Amplifikacja 20 sekwencji polimorficznych w reakcjach typu multipleks (mikrosatelity). Znakowanie starterów fluorochromami. Automatyczny odczyt długości fragmentów. Analiza fragmentów MHC przy pomocy enzymów restrykcyjnych. c) Analiza: Charakterystyka populacji - określenie parametrów populacyjnych (równowaga genetyczna; heterozygotyczność; współczynniki Writha), ocena dystansu. 2. Analiza rodowodowa polegająca na ocenie rodowodów stad za granicą i wskazania najlepszych możliwych do realizacji rozwiązań przywozu nowych osobników do wzbogacania bieszczadzkiego stada. Analiza rodowodowa obejmuje ocenę podobieństwa genetycznego, składu genotypu pod względem udziału przodków i przynależności do linii matecznej i ojcowskiej. IV. Wykonawca do 15 grudnia każdego roku obowiązywania umowy będzie przedstawiał raporty zawierające wyniki analizy molekularnej każdej próby, analizę stad i osobników potencjalnie możliwych do przemieszczenia w celu wzbogacenia stad bieszczadzkich żubrów oraz wskazanie innych działań zmierzających do wzbogacenia puli genowej stada bieszczadzkiego. Oprócz tych raportów do 15 czerwca każdego roku Wykonawca będzie przedstawiał informację z bieżącej realizacji zadania. Do 20 grudnia 2013 roku Wykonawca przedstawi raport końcowy, stanowiący podsumowania całego monitoringu genetycznego. Informacje półroczne, raporty z realizacji zadania i raport końcowy powinny być dostarczone do siedziby Zamawiającego. Zadanie nr 2 Przedmiotem zamówienia jest: Monitoring parazytologiczny I. Monitoring parazytologiczny ma na celu określenie stopnia zapasożycenia, oraz wskazanie metod profilaktyki orazlub leczenia chorób pasożytniczych żubrów z populacji bieszczadzkiej 1. Wykonawcy zostaną dostarczone próbki do oceny zapasożycenia zebrane w ramach zadania Kolekcja tkanek żubrów ze stada w Bieszczadach. Sposób dostarczania próbek do analizy zostanie ustalony z Wykonawcą ww zadania. 2. Materiał biologiczny dostarczony do badań będzie stanowić kał żubrów. 3. Ilość materiału dostarczonego do analizy to 80 próbek rocznie. II. Metodyka oceny stopnia zapasożycenia: 1. Próbki muszą być zbadane metodami pozwalającymi na ustalenie ekstensywności i intensywności zarażenia żubrów nicieniami żołądkowo-jelitowymi, nicieniami płucnymi i przywrami wątrobowymi. Analizy należy przeprowadzić trzema metodami: a) Metodą flotacji w kierunku wykrycia jaj nicieni z rodziny Trichostrongylidae, rodzaju Nematodirus, rodzaju Trichocephalus i rodzaju Aonchoteca; b) Metodą Baermanna w celu wykrycia larw nicieni płucnych Dictyocaulus viviparus; c) Metodą dekantacji w kierunku wykrycia jaj przywr wątrobowych Fasciola hepatica, Parafasciolopsis fasciolaemorpha i Dicrocoelium dendriticum oraz przywr Paramphistomum cervi występujących w żwaczu. III. Wykonawca do 15 grudnia każdego roku trwania umowy będzie przedstawiał raport z bieżącej realizacji zadania, zawierający wyniki analizy każdej próby oraz zalecenia dotyczące profilaktyki i leczenia chorób pasożytniczych. Ponadto do 20 grudnia 2013 roku Wykonawca przedstawi podsumowujący raport końcowy. Raporty z realizacji zadania i raport końcowy powinny być dostarczone do siedziby Zamawiającego. IV. Wykonawca w przypadku wystąpienia zagrożenia zdrowia żubrów niezwłocznie poinformuję o tym Zamawiającego, wskaże źródło zagrożenia oraz przedstawi zalecenia dla ochrony zdrowia populacji żubrów. Zadanie nr 3 Przedmiotem zamówienia jest: Monitoring zdrowia populacji południowej I. Monitoring zdrowia populacji południowej (liczebność populacji została szacunkowo określona no około 300 osobników w 2010 roku), ma na celu ocenę populacji żubrów pod kątem występowania chorób bakteryjnych i wirusowych. II. Metodyka monitoringu zdrowia: 1. Wykonanie sekcji anatomopatologicznej każdego padłego lub eliminowanego żubra. Wykonawca jest zobowiązany do przyjazdu na miejsce przechowywania padłego lub wyeliminowanego osobnika. 2. Pobieranie materiału biologicznego w formie wycinków tkanek i wymazów ze zmienionych narządów padłego lub wyeliminowanego żubra. Próby będą pobierane w miejscu przechowywania żubra. 3. Decyzja o zakresie badań dodatkowych (histopatologicznych, mikrobiologicznych, mykologicznych, serologicznych) podejmowana będzie przez lekarza weterynarii wykonującego autopsję. III. W przypadku wystąpienia lub podejrzenia gruźlicy, Wykonawca jest zobowiązany do zbadania próbek w kierunku gruźlicy w laboratorium referencyjnym wskazanym przez Głównego Lekarza Weterynarii, pod warunkiem możliwości pobrania próbek do tych badań. IV. Wykonawca zapewni niezbędne odczynniki i pojemniki dla pobierania i utrwalania materiału biologicznego oraz opracuje szczegółową instrukcję sposobu jego pobierania i utrwalania, po uzgodnieniu z Zamawiającym. V. Wykonawca do 15 grudnia danego roku trwania umowy będzie zobowiązany do przedstawienia raportu z bieżącej realizacji zadania przez okres realizacji umowy, zawierającego szczegółowe wyniki prowadzonych autopsji i badań dodatkowych. Raport będzie zawierał również ewentualne zalecenia dla ochrony zdrowia żubrów w danej populacji. Ponadto Wykonawca do 20 grudnia 2013 roku przedstawi podsumowujący raport końcowy. Raporty z realizacji zadania i raport końcowy ma być dostarczony do siedziby Zamawiającego. VI. Wykonawca w przypadku wystąpienia zagrożenia zdrowia żubrów niezwłocznie poinformuję o tym Zamawiającego, wskaże źródło zagrożenia oraz przedstawi zalecenia dla ochrony zdrowia populacji żubrów..