Przetarg 7343883 - ZP/20/2020 – Dostawa odczynników dla Zakładu Genetyki...

1. 0,25 % roztwór trypsyny w PBS nie zawierający wapnia, magnezu i czerwieni fenolowej, sterylny, 1 op. = 500 ml – 10 000 ml.
Pakiet nr 2Pakiet nr 21. barwnik o niebieskiej fluorescencji używany m.in. w technice Fish – gotowy roztwór (0,125 ng/ml) – DAPI II Counterstain in Antifade – 8 ml;2. odczynnik niejonowy do przygotowania roztworów płuczących używanych w technice Fish – 20 ml;3. elastyczny usuwalny klej na bazie kauczuku naturalnego i rozpuszczalników organicznych umożliwiający sklejenie i ponowne rozklejenie mikroskopowego szkiełka podstawowego i nakrywkowego. Nadający się do stosowania m.in. w technice Fish – 500 g;4. sonda molekularna używana w technice Fish do diagnostyki mikrodelecji i mikroduplikacji w regionie 22q11.2 w chromosomie 22. Komplementarna do genu TUPLE1. Sonda kontrolna w regionie 22qter (gen ARSA) – 40 testów;5. sonda molekularna używana w technice Fish do diagnostyki mikrodelecji i mikroduplikacji w regionie 15q11.2 w chromosomie 15. Komplementarna do genu SNRPN. Sonda kontrolna w regionie 15qter. – 30 testów
Pakiet nr 3Pakiet nr 3:1. podłoże RPMI 1640 ze stabilizowaną L-glutaminą, 25mM Hepes, produkt sterylny z czerwienią fenylową w opakowaniach 100 ml – 70 000 ml.
Pakiet nr 4Pakiet nr 4:1. pojemnik z buforem anodowym do aparatu Genetic Analyzer 3500 Applied Biosystems – 80 szt.;2. pojemnik z buforem katodowym do aparatu Genetic Analyzer 3500 Applied Biosystems – 80 szt.;3. GeneScan 600 LIZ Size Standard v2.0 – barwnik fluorescencyjny wykorzystywany do analizy fragmentów 20-600 bp, do aparatu Genetic Analyzer 3500 Applied Biosystems – 2 400 reakcji;4. bufor do zestawu do znakowania BigDye Terminator v.3.1 Cycle Sequencing Kit firmy Applied Biosystems lub równoważny wymagany w procedurze sekwencjonowania Sangera, stężony 5x – 50 ml;5. BigDyeTerminator 3.1 Cycle Sequencing Kit – zestaw do analizy DNA metodą sekwencjonowania, do sekwenatora 3500 Genetic Analyzer Applied Biosystems (wg tego odczynnika urządzenie jest skalibrowane); opakowanie na 100 reakcji – 10 000 reakcji;6. Formamid Hi-Di (highly deionized), wymagany w procedurze precypitacji DNA, służący do elektroforezy kapilarnej, do sekwenatora 3500 Genetiv Analyzer Applied Biosystems. Pakowany w buteleczkach po 25 ml – 375 ml;7. Glikogen – odczynnik do precypitacji DNA, wysokooczyszczony (Molecular Biology Grade) polisacharyd wyizolowany z ostryg. Jest obojętnym nośnikiem, który zwiększa pozyskanie kwasów nukleinowych z wytrącania alkoholem. Pakowany po 2 x 0,25 ml – 10 ml;8. 3M octan sodu, pH 5,2 – odczynnik do precypitacji DNA, wolny od Dnazy i Rnasy, przefiltrowany przez membranę 0,22 um, sterylny. Pakowany po 5 x 1 ml – 75 ml;9. ExoSAP – Odczynnik do enzymatycznego oczyszczania produktów po reakcji PCR przed sekwencjonowaniem metodą Sangera; zapewniający jednoetapowe oczyszczanie bez konieczności łączenia exonukleazyI i alkalicznej fosfatazy z krewetek; ilość nie większa niż 1μl na 2,5μl produktu PCR; 2-stopniowa inkubacja: 37oC 15 min, 80oC 15 min. 1 opakowanie wystarcza na 2000 reakcji – 12 000 reakcji;10. POP−7 Polimer do sekwenatora Genetic Analyzer 3500, wielkość 384 reakcji – 3 840 reakcji;11. POP−7 Polimer do sekwenatora Genetic Analyzer 3500, wielkość 960 reakcji – 7 680 reakcji;12. standard kit do kalibracji sekwenatora Genetic Analyzer 3500 Applied Biosystems (do sekwencjonowania) The BigDye Terminator v3.1 sequencing standard kit – 4 szt.
Pakiet nr 5Pakiet nr 5:1. odczynnik służący do barwienia kwasów nukleinowych bez toksycznego bromku etydyny. Doskonała czułość w wizualizacji ze wzbudzeniem UV lub światła niebieskiego. Po związaniu z kwasami nukleinowymi zielona fluorescencja ma maksimum fluorescencji przy fali 280 i 502 nm oraz maksimum emisji przy 530 nm. Dostarczany jako koncentrat 10 000x w DMSO. Barwnik można mieszać z żelem agarozowym. Pakowany po 400 ul – 12 000 μl;2. barwnik służący do przygotowania markerów DNA oraz próbek w celu umieszczania w żelu agarozowym. Zawiera dwa różne barwniki – błękit bromofenolowy i ksylocyjan FF do wizualizacji śledzenia migracji DNA podczas elektroforezy. Zawiera EDTA które wiąże jony metali i hamuje nukleazy. Stężony 6x, pakowany po 5 x 1 ml – 25 ml;3. wzorzec mas o zakresie 100 – 1 000 pz; Istotny zakres mas i czytelny rozdział poszczególnych wielkości mas w żelu agarozowym, gotowy do użycia. Pakowane po 50 ug (100 aplikacji) – 500 μg;4. wzorzec mas o zakresie 50 – 1 000 bp; Istotny zakres mas i czytelny rozdział poszczególnych wielkości mas w żelu agarozowym, gotowy do użycia. Pakowane po 50 ug (100 aplikacji) – 1 000 μg;5. wzorzec mas o zakresie 10 - 300 bp; Istotny zakres mas i czytelny rozdział poszczególnych wielkości mas w żelu agarozowym, gotowy do użycia. Pakowane po 50 ug (100 aplikacji) – 250 μg.
Pakiet nr 6Pakiet nr 6:1. gotowy do użycia zielony multiplex master mix, odporny na inhibitory, swoisty i skuteczny do multipleksowania do 2,5 kb. Posiada 2 barwniki, które umożliwiają wizualizację produktów na żelu, bezpośrednio. Oparty na polimerazie Phusion Hot Start. Może być stosowany nawet do nieoczyszczonych próbek, jak krew lub surowica. Wielkość opakowania 100 reakcji – 2 000 reakcji;2. zestaw do syntezy cDNA z primerami typu losowych oligonukleotydów. Wielkość 200 reakcji – 4 000 reakcji;3. gotowy do użycia w reakcji PCR mastermiks do RT-qPCR, zoptymalizowany do badania ekspresji genów oraz zwalidowany do badania ekspresji miRNA, zawierający ROX jako barwnik pasywny, zoptymalizowany do pracy z sondami hydrolizowalnymi (TaqMan). Pakowany po 5 ml – 100 ml;4. gotowy do użycia w reakcji PCR mastermiks do RT-qPCR, zoptymalizowany do badania ekspresji genów, zawierający Urydylotransferazę DNA, ROX jako barwnik pasywny oraz SYBR Green. Pakowany po 5 ml – 100 ml.
Pakiet nr 7Pakiet nr 7:1. zestaw do izolacji DNA z krwi obwodowej do automatu MagCore – 9 600 reakcji;2. zestaw do izolacji DNA z hodowli komórkowych i płynu owodniowego do automatu MagCore – 768 reakcji;3. zestaw do izolacji całkowitego RNA z krwi obwodowej do automatu MagCore – 192 reakcji;4. zestaw do izolacji całkowitego RNA z kultur hodowlanych do automatu MagCore – 192 reakcji;5. zestaw do izolacji DNA z tkanek do automatu MagCore – 192 reakcji;6. zestaw do izolacji DNA z próbek kryminalistycznych, takich jak zaschnięta plamka krwi, próbki wymazów do automatu MagCore – 192 reakcji;7. zestaw do izolacji wolnokrążącego DNA do automatu MagCore wraz z wymaganym dodatkowym rackiem, umożliwiającym większą objętość próbki wejściowej (4 ml) – 192 reakcji;8. zestaw do oczyszczania i zatężania DNA z reakcji enzymatycznych w oparciu o zastosowanie kuleczek magnetycznych. Zestaw do oczyszczania określonych zakresów fragmentów DNA z PCR, trawienia endonukleazami, ligacji, usuwania adapterów itp. Zestaw umożliwia selektywne wiązanie fragmentów DNA na podstawie objętości bufora dodanego do próbki. Zestaw umożliwia elucję ≥ 25 μl DNA w przypadku zastosowania płytek 96 – dołkowych i ≥ 10 μl DNA w przypadku zastosowania probówek. Eluat może zostać wykorzystany do ligacji, trawienia enzymami restrykcyjnymi, sekwencjonowania nowej generacji, przygotowywania bibliotek. Objętość buforu wchodzącego w skład zestawu nie mniej niż 10 ml. Zestaw umożliwia przeprowadzenie całej procedury w 10 minut. Wydajność uzyskanego DNA nie gorsza niż ≤ 10 μg DNA Zakres wielkości ≥ 100 bp – 50 ml;9. odczynnik stabilizujący wolnokrążące DNA (cfDNA) do 14 dni, genomowe DNA (gDNA) oraz wolnokrążące komórki nowotworowe (CTCs) do 7 dni,w zakresie temperatury 6–37 stopni Celsjusza, w gotowych szklanych probówkach wraz z próżniowym systemem do pobierania krwi. Pojemność: 9,8 ml krwi, 1,8 ml odczynnika – 800 szt.
Pakiet nr 8Pakiet nr 8:1. Salsa MLPA probemix – 25 reakcji;1 opakowanie = 25 reakcji – 1 500 reakcji;2. Salsa MLPA probemix – 50 reakcji;1 opakowanie = 50 reakcji – 1 500 reakcji;3. Salsa MLPA – 100 reakcji;1 opakowanie = 100 reakcji – 4 000 reakcji.
Pakiet nr 9Pakiet nr 9:1. 3 % Agarose, dye-free, w/ internal standards, BluePippin, 100–250 bp, 10/pk, Marker Q3 – kompletny zestaw kaset żelowych i odczynników kompatybilnych z urządzeniem BluePippin pozwalający na selekcję fragmentów DNA w zakresie 100–250 pz. Zestaw dla 50 prób. Do posiadanego aparatu BluePippin – 600 próbek;2. 2 % Agarose, dye-free, w/ internal standards, BluePippin, 100–600 bp, 10/pk, Marker V1 – kompletny zestaw kaset żelowych i odczynników kompatybilnych z urządzeniem BluePippin, pozwalający na selekcję fragmentów DNA w zakresie 100–600 pz. Zestaw dla 50 prób. Do posiadanego aparatu BluePippin – 500 próbek.